本場前身創立於民國17年，原稱為臺東廳農會種牛繁殖場，光復後先後改稱為臺東縣農事試驗場及臺東縣農林總場。民國39年11月由臺東縣農林總場改組成立為臺灣省臺東區農林改良場，隸屬於臺灣省政府農林廳。民國41年5月臺灣省農林試驗所臺東熱帶農業試驗分所裁併本場，自此規模更臻完備。民國49年7月1日改稱為臺灣省臺東區農業改良場。民國65年4月各區農業改良場畜牧業務劃歸臺灣省畜產試驗所統轄。民國72年12月斑鳩工作站奉准改設斑鳩分場續屬本場管轄。民國88年7月1日精省後改隸行政院農業委員會。
| 時 間 | 沿 革 摘 述 |
|---|---|
| 民國17年 | 成立臺東廳農會種牛繁殖場 |
| 民國22年 | 改稱臺東廳農會種畜場 |
| 民國22年 | 改隸臺東廳種畜場 |
| 民國35年 | 接收臺東縣種畜場 |
| 民國36年 | 成立臺東縣農事試驗場 |
| 民國37年 | 合併為臺東縣農林總場 |
| 民國39年 | 改組成立臺灣省臺東區農林改良場 |
| 民國49年7月1日 | 改稱臺灣省臺東區農業改良場 |
| 民國65年4月 | 各區農業改良場畜牧業務劃歸臺灣省畜產試驗所統轄 |
| 民國72年12月 | 斑鳩工作站奉准改設斑鳩分場續屬本場管轄 |
| 民國88年7月1日 | 精省後改隸行政院農業委員會臺東區農業改良場 |
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